Doku ve organlarda oluşan enfeksiyon hastalıkları, virüs, bakteri, mantar ya da parazit gibi mikroorganizmaların vücudu enfekte etmesi sonucu oluşur.
Bu hastalıkların bazıları bulaşıcı olabilirken bazıları sadece konak olarak tanımlanan enfekte olmuş kişinin hastalanmasına neden olur.
Enfeksiyona bağlı tüm hastalıkların tanıları ve tedavileriyle enfeksiyon hastalıkları ve klinik mikrobiyoloji bölümü doktorları ilgilenir.